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一人公司缴纳的是企业所得税，之后对自然人股东分配利润的时候，再扣缴一次个人所得税。
而个人独资企业，不适用《企业所得税法》，它是穿透个人独资企业层面，直接缴纳出资人的个人所得税。
此外，虽然在所得税法上，个人独资企业被视为个人、缴纳个人所得税。但是，在增值税法上，个人独资企业是作为单位纳税人进行税务登记的。
其实，对于个人独资企业的所得税来说，在2000年以前也是缴纳企业所得税的，2000年以后才开始停征企业所得税，改为征收个人所得税。
答：这个是可以的。在《公司法》的一般规定上，并没有限制股东的身份。并且，税法上也有相关规定，个人独资企业以投资者身份向公司投资的时候，收到的分红是穿透个人独资企业层面而缴纳个人所得税的，这也是一个佐证，说明是可以的。
《国务院关于个人独资企业和合伙企业征收所得税问题的通知》(国发[2000]16号)规定，自2000年1月1日起，对个人独资企业和合伙企业停止征收企业所得税，其投资者的生产经营所得，比照个体工商户的生产、经营所得征收个人所得税。
为了认真贯彻落实国发[2000]16号文件精神，切实做好个人独资企业和合伙企业投资者的个人所得税征管工作，财政部、国家税务总局制定了《关于个人独资企业和合伙企业投资者征收个人所得税的规定》(财税[2000]91号发布，以下简称《规定》)，对个人独资企业和合伙企业投资者的生产经营所得征收个人所得税作出了详细规定。
2.《财政部 国家税务总局关于合伙企业合伙人所得税问题的通知》(财税[2008]159号)第二条规定：合伙企业以每一个合伙人为纳税义务人。合伙企业合伙人是自然人的，缴纳个人所得税;合伙人是法人和其他组织的，缴纳企业所得税。
具体应纳税所得额的计算按照《关于个人独资企业和合伙企业投资者征收个人所得税的规定》(财税[2000]91号)及《财政部 国家税务总局关于调整个体工商户个人独资企业和合伙企业个人所得税税前扣除标准有关问题的通知》(财税[2008]65号)的有关规定执行。
2、个人独资企业个人所得税纳税人个人独资企业以投资者个人为纳税人，比照个人所得税法的\"个体工商户的生产经营所得\"应税项目，适用5%~35%的5级超额累进税率，计算征收个人所得税。
3、个人独资企业分支机构个人所得税纳税人
个人独资企业设立分支机构，属于投资者兴办的又一个人独资性质的企业，其纳税人仍为投资者个人，比照个人所得税法的\"个体工商户的生产经营所得\"应税项目，适用5%~35%的5级超额累进税率，计算征收个人所得税。
这也是部分人对个人独资企业分支机构做“个人所得税-个体工商户的生产经营所得”税种认定的缘由。
个人独资企业投资者转让的情况目前较为普遍，个人独资企业能否转让？《个人独资企业法》第十七条规定，个人独资企业投资人对本企业的财产依法享有所有权，有关权利可以依法进行转让或继承。《个人独资企业登记管理办法》第十七条规定，个人独资企业因转让或者继承致使投资人变化的，可向原登记机关提交转让协议书或者法定继承文件，申请变更登记。上述规定明确个人独资企业投资者允许转让，这种行为能否认定为财产转让？转让时是否按“财产转让”税目缴纳个人所得税？现行税收规范性文件的规定不够明确。本文结合网上的一篇《个人独资企业转让后，转让前债务应如何承担》的案件，分析个人独资企业投资者转让如何适用个人所得税政策进行简要分析。